Con el franco marroquí en el banquillo el equipo realiza una buena segunda vuelta y a falta de dos jornadas logra certificar matemáticamente la disputa de la valencia camiseta 2024 promoción de ascenso. En su primera temporada en el equipo blanquiazul logró el ascenso a Primera, y en su segunda se quedaba con el amargo sabor de no disputar la Copa de la UEFA por la diferencia de goles con el 4.º clasificado, la Real Sociedad. Desde el comienzo en primera fase enfrentaron a Libertad, ganando 4:0 en el global, Valencia terminó como el mejor jugador del partido. El defensor, como tocado por la varita mágica de Pérez, metió un cabezazo, y la hazaña quiso que el arquero Armani lo atajara y que diera rebote. En una jugada, en principio confusa, Ortega encaró a un defensor neerlandés y cayó en el área sobre el final del encuentro, la inmediata repetición televisiva demostró que fingió la falta dejándose caer; según los mismos cronistas argentinos, «-él se tira, clarísimo, se tira, como se tira siempre-«.

Para la temporada 2012/13, el Burgos Club de Fútbol decidió no inscribir al equipo para que hubiera competido una temporada más en la Segunda División B. Problemas deportivos por la ausencia de varios jugadores importantes que ya habían comunicado que no iban a continuar y sobre todo problemas económicos ante la bajada de subvención por parte del patrocinador y del ayuntamiento, hicieron que la sección desapareciese. Ortega cerró su segundo Mundial con 3 asistencias servidas y 2 goles convertidos, y teniendo un nivel superlativo que lo hizo ser una de las máximas figuras de esta competencia. Ortega fue otra vez la figura del campo y tuvo un partido extraordinario. Marcado por un ritmo frenético, chistes hilarantes y gags continuos está al alcance de los espectadores más jóvenes, pero cuenta a la vez con una trama no del todo carente de referencias a la sátira política, con guiños a Woody Allen.

Ortega fue convocado por Diego Maradona para vestir una vez más la camiseta albiceleste en el amistoso frente a Haití el 5 de mayo de 2010 en el Estadio del Club Alianza, Neuquén. Argentina fue el rival de Brasil, que luego sería el campeón de la competencia, y fue derrotada por 2 goles contra 1, quedando eliminada, siendo este el único partido disputado por el «10» ya que tuvo que cumplir 3 fechas de suspensión que arrastraba por la expulsión sufrida frente al seleccionado neerlandés en el Mundial de Francia 1998. Durante la fase de grupos, el Burrito fue reemplazado por el juvenil Juan Román Riquelme con la dorsal número 22. Varios años después, Riquelme iba a quedarse con la 10 cuando Ortega dejó de integrar la selección argentina. Diversos requerimientos económicos y judiciales fueron la gota que colmaron el vaso, entre ellos el protagonizado por José Granell, presidente del grupo Aedifica que formó parte, junto al grupo Bankia Hábitat, del proyecto Newcoval, un plan firmado por el expresidente Manuel Llorente con Bankia en diciembre de 2011 para finalizar las obras del futuro estadio a cambio de trasladar la ciudad deportiva a unos terrenos propiedad de Bankia en Náquera (incumpliendo así lo firmado años antes con el ayuntamiento de la población de Ribarroja del Turia) y de la cesión y explotación por parte de Newcoval de casi todo el patrimonio del club, el cual seguiría endeudado pero sin apenas patrimonio ni ingresos ni posibilidad de invertir en formar un gran equipo.

Años después el propio Ortega reconocería “Si no me expulsaban, teníamos muchas chances de ganar. La intervención más importante de Ortega en este Mundial fue consiguiendo que cobren un penal en el minuto ’88 para la selección argentina en su último partido frente a Suecia, tras un regate que el mismo efectuó en el área rival. El último partido por la fase de grupos fue frente a Uruguay, obteniendo una victoria por 2-0, clasificando a Cuartos de final. Era hora de que se disputara una nueva Copa Mundial de Fútbol, y Ortega, como no podía ser de otra manera, era convocado para participar su tercer Mundial consecutivo. Ariel Ortega continuaba con grandes actuaciones en el seleccionado en la era que transcurría luego del Mundial 1994 y que tenía a Passarella como entrenador. Ortega fue increpado por el arquero Edwin Van der Sar, por lo que se levantó con mucha furia del piso y le propinó un cabezazo al arquero neerlandés, lo que le valió la expulsión, calificada ésta, de gran «irresponsabilidad de Ortega» por parte de Fernando Niembro, entre otros cronistas argentinos de la época. El gol de los suecos fue convertido por Anders Svensson de tiro libre, y el de los argentinos fue anotado por el centrodelantero Hernán Crespo.