En el primer semestre de 2011 el equipo no tuvo un buen rendimiento en el Estadio Alfonso López y perdió todos los partidos que disputó de visitante, llegando a ser goleado en tres ocasiones, lo que no había ocurrido nunca durante su permanencia en la Categoría Primera B. Al final de la fecha 12 el Atlético Bucaramanga había caído hasta el puesto 12 de la reclasificación y al último lugar del hexagonal regional de la Copa Colombia, por lo que periodistas y aficionados pidieron la salida del técnico Fernando Velasco como solución a la crisis del plantel. Alianza Lima ganaría el Hexagonal de manera invicta luego de vencer a Universitario, Mannucci, Sporting Cristal, Universidad César Vallejo y Atlético Trujillo, por lo que le tocaría jugar de local en las Semifinales contra el cuarto lugar del Hexagonal, Sporting Cristal. Para la Etapa Regional, Alianza Lima se reforzó con cinco jugadoras de los equipos eliminados en la Zona Lima: Sandy Dorador (Sporting Cristal), Emily Flores (Universidad César Vallejo), Diana Alfaro (Sporting Cristal), Annie Del Carpio (Universidad San Martín) y Anais Vilca (Deportivo Municipal). Tras golear 4-0 a la Academia Cantolao en el Repechaje, la Universidad César Vallejo se convirtió en el rival de Alianza Lima en las Semifinales del torneo.
En dicho duelo, el cuadro trujillano rompió el invicto del arco aliancista para terminar empatando 1-1 en el tiempo reglamentario y forzando la definición por penales, la cual favoreció a las íntimas por 5-4, logrando así clasificar a la final nacional del fútbol femenino. El cuadro rimense logró empatar 0-0 en el barrio de Matute y forzó los penales, que terminarían 4-3 a favor de las campeonas vigentes. Por su parte, las victorianas terminaron en cuarto lugar con 22 puntos en la Primera Etapa, con 6 triunfos, 4 empates y 4 derrotas, por lo que tuvieron que disputar el Playoff Zonal contra Deportivo Municipal, al que derrotaron por 4-0 y, luego, disputar la Semifinal Zonal ante Sporting Cristal, al que vencieron por 4-3 en penales, camisetas nba baratas tras empatar 1-1 en el tiempo oficial. Por su parte, Universitario hacía lo mismo en su grupo: 10-0 a Atletic San Miguel FC, 4-0 a Athletic Villa, 5-0 a JC Sport Girls. 4-0 a Talemtus Callao y 5-0 a Partizan Barranco, logrando su clasificación a la Final Regional de manera holgada, invicta y sin goles en contra.
El Grupo A estuvo conformado por Alianza Lima, CD Partizan Barranco, Villa Libertad y Talemtus Callao y el Grupo B, por Universitario, JC Sport Girls, Atletic San Miguel y Athletic Villa. Fue disputada por los seis equipos clasificados de la Liga Departamental de Lima (JC Sport Girls, Partizan Barranco, Talemtus Callao, Villa Libertad, Atletic San Miguel FC y Athletic Villa) y los dos equipos clasificados de la Zona Lima (Universitario y Alianza Lima). Para un completo detalle véase Máximos anotadores de la Liga ACB. Cada detalle es cuidadosamente pensado para transmitir orgullo y pasión por el equipo. ↑ En la época no había pautas establecidas en caso de empate, por lo que si en una eliminatoria de dos partidos cada equipo ganaba un encuentro, independientemente de los goles realizados, era considerado empate y debían disputarse tantos partidos de desempate como fueran necesarios hasta que en alguno de ellos hubiera un vencedor. Como se esperaba, Universitario logró ganar la Primera Etapa de manera invicta, con 40 puntos, trece triunfos y un empate ante Alianza Lima, por lo que clasificó directamente a la Final Zonal y a la Etapa Regional. En 2021, la Federación Peruana de Fútbol organizó la primera edición de la Liga Femenina FPF, torneo que contó con trece equipos participantes y en el que las Íntimas lograrían su primer título nacional de fútbol femenino.
Como en la temporada pasada, la Liga Femenina FPF 2022 tuvo trece equipos participantes y el rival a vencer sería nuevamente Universitario, pero el sorpresivo Carlos Mannucci de Trujillo quebraría los pronósticos iniciales. Condiciones que pocos clubes ofrecen a sus jugadoras en la Liga Femenina. Por ello, renovó a casi todo el plantel campeón de 2021 y se reforzó con jugadoras del fútbol local como Sandra Arévalo (Cristal), Rosa Castro (Municipal) y Gianella Romero (Universitario) para jugar la Primera Fase, y las repatriadas Liliana Neyra, Steffani Otiniano y Maryory Sánchez junto a la colombiana Sofía García para competir en la parte final del torneo. Luego del éxito obtenido en la primera edición de la Liga Femenina FPF y tras la buena campaña en la Copa Libertadores Femenina 2021, Alianza Lima se puso como objetivo en 2022 lograr el bicampeonato nacional para volver a competir internacionalmente. Como todos los partidos del torneo, la final se jugó sin público en el Estadio de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, debido a las restricciones sanitarias impuestas por el gobierno peruano frente a la pandemia del Covid 19. En un partido muy reñido y parejo, Alianza Lima venció por 1-0 a las cremas con gol de la venezolana Neidy Romero y se adjudicó de manera invicta la Liga Femenina FPF 2021. Con la obtención del título, las blanquiazules también lograron clasificar por primera vez a la Copa Libertadores Femenina, que ese año se jugó principalmente en Asunción, Paraguay.